Protein interaction with different ligands including drugs, substrates and different inhibitors is of considerable importance in biology, medicine and pharmacy.

Among the various approaches, Docking has many applications because of its high speed, simplicity along with a lot of information which is obtained from it.

This course will be useful for those researchers who study pharmacy, cellular and molecular biology, biochemistry and other fields which deal with protein interactions with other molecules. In addition, this workshop is recommended to those people who want to be familiar with potentials in this context in order to have common collaborations.

Topics of course:

1. Linux principles, how to connect to server and file transferring
2. Getting familiar with Linux terminal commands
3. An introduction to PDB database and information extracting
4. Getting familiar with PDB file format.
5. Docking theory
6. How to work with Autodock software
7. Analyzing of results derived from Docking.

برهم کنش پروتئین با لیگاندهای مختلف از جمله داروها ، سوبسترا ها و مهار کننده ها ی مختلف در مطالعات مختلف زیست شناسی، پزشکی و داروسازی از اهمیت قابل توجهی برخوردار است. در میان روش های مختلف، داکینگ بخاطر سرعت عمل و .سادگی ، در کنار اطلاعات خوبی که از آن منتج می شود کاربردهای فراوانی دارد

این دوره برای محققان رشته های داروسازی، سلولی- مولکولی، بیوشیمی و دیگر رشته هایی که مطالعات مربوط به ارتباط پروتئین و مولکولهای دیگر انجام میدهند مفید است. علاوه بر این، افرادی که میخواهند پتانسیل های موجود در این زمینه را به منظور همکاری های مشترک بشناسند نیز توصیه می شود.

سرفصل های دوره:

1. مباني لينوكس نحوه ارتباط با سرور و انتقال فايل
2. آشنايي با فرامين ترمينال لينوكس
3. معرفي ديتابيس PDB و نحوه استخراج اطلاعات
4. آشنايي با فرمت فايل pdb
5. تئوري داكينگ
6. آموزش نرم افزار autodock بصورت عملي
7. آناليز نتايج حاصل از داكينگ

ارائه دهندگان:

اقای دکتر سيد شهريار عرب
صابر محمدي
آناهيتا خمری

Workshop Slides